| N | Управление, отдел | Должность |
| 1 | 2 | 3 |
| 1 | Административное управление | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Отдел секретариата и протокола | Советник |
| 2 | Планово-финансовое управление | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Административно-хозяйственный отдел | Консультант |
| Главный специалист-эксперт |
| Ведущий специалист-эксперт |
| Старший специалист 1 разряда |
| Старший специалист 2 разряда |
| 3 | Управление материально-технического обеспечения | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Отдел государственных закупок | Главный специалист-эксперт |
| 4 | Управление надзора и контроля в сфере обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Консультант |
| Главный специалист-эксперт |
| Ведущий специалист-эксперт |
| Специалист-эксперт |
| 5 | Управление организации научных исследований | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Отдел сводного планирования и информатики | Главный специалист-эксперт |
| 6 | Управление правового обеспечения и государственной службы | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Судебно-договорной отдел | Главный специалист-эксперт |
| 7 | Управление капитального строительства и имущественных отношений | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Консультант |
| Главный специалист-эксперт |
| Ведущий специалист-эксперт |
| Специалист-эксперт |
| 8 | Управление организации медицинской помощи | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| 9 | Управление организации службы крови | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Отдел контроля и надзора в сфере донорства крови и ее компонентов | Консультант |
| Главный специалист-эксперт |
| Ведущий специалист-эксперт |
| 10 | Управление медико-социальной экспертизы и социальной поддержки населения | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| Консультант |
| Главный специалист-эксперт |
| Ведущий специалист-эксперт |
| Специалист-эксперт |
| 11 | Управление организации спортивной медицины | Начальник управления |
| Заместитель начальника управления |
| Начальник отдела |
| Заместитель начальника отдела |
| 12 | Территориальные органы ФМБА России | Руководитель |
| Заместитель руководителя |
| Начальник отдела |
| Консультант |
| Главный специалист-эксперт |
| Ведущий специалист-эксперт" |