| | | | Заместитель начальника управления - начальник службы силового обеспечения | | | |
| | | | | | | | | | | |
| | | | | | | | | | | |
| | Заместитель начальника службы - начальник отдела организации службы таможенной охраны и специальных отрядов быстрого реагирования | | Специальный отряд быстрого реагирования (на правах отдела) | | Отделение документационного обеспечения | |
| | | | |
| | | | | |
| | | | | | Авиационный отдел (отделение) | |
| | | Оперативно-боевое отделение | | |
| | | | | | | | |
| | Отдел организации службы таможенной охраны и специальных отрядов быстрого реагирования | | | | | | |
| | | | | | Морской отдел (отделение) | |
| | | | | | |
| | | | | | | |
| | | | | | Оперативно-дежурный отдел | |
| | | | | | | | | | |
| | Отделение организации оборота оружия и использования технических средств охраны | | | | | | |
| | | | | | Отдел таможенной охраны | |
| | | | | | |
| | | | | | | | | | | |
| | Отделение организации службы таможенной охраны | | | | | Речной отдел (отделение) | |
| | | | | | |
| | | | | | | |
| | | | | | | | | | | |
| | Отделение организации службы специальных отрядов быстрого реагирования | | | | | | |
| | | | | | | |
| | | | | | | |