| Заместитель начальника таможни по информационно-техническому обеспечению | |
| | | | | | |
| Отдел эксплуатации функциональных подсистем и информационного обеспечения | | | Отделение защиты информации |
| | |
| | | | |
| | | Отделение эксплуатации средств связи |
| | | | |
| Отдел телекоммуникаций и системотехнического обеспечения средств вычислительной техники | | |
| | | | |
| | | Отдел связи |
| | |
| | | | | | |
| Отделение эксплуатации и администрирования локальных вычислительных сетей | | | Отдел (отделение) таможенного контроля за делящимися и радиоактивными материалами |
| | |
| | | | |
| Отдел технических средств таможенного контроля и технических средств охраны | | | | |
| | | Первый заместитель начальника таможни по организации таможенного контроля |
| | |
| | | | |
| Отделение анализа применения и организации эксплуатации технических средств контроля и технических средств охраны | | | | |
| | | | |
| | | | | | |
| Отделение технического обслуживания и ремонта технических средств контроля и технических средств охраны | | | | |
| | | | |