| N п/п | Наименование должностей федеральной государственной гражданской службы | Количество должностей |
| Руководство |
| 1. | Помощник руководителя федерального агентства | 2 |
| 2. | Помощник руководителя федерального агентства (пресс-секретарь) | 1 |
| 3. | Советник руководителя федерального агентства | 1 |
| Управление развития поисковых исследований и новых технологий |
| 1. | Начальник управления | 1 |
| 2. | Заместитель начальника управления | 2 |
| 3. | Заместитель начальника управления - начальник отдела перспективных технологий, наносистем и новых материалов | 1 |
| Управление программ и проектов |
| 1. | Начальник управления | 1 |
| 2. | Заместитель начальника управления | 3 |
| 3. | Заместитель начальника управления - начальник отдела нормативного обеспечения программ и проектов | 1 |
| Управление инновационного развития и инфраструктуры |
| 1. | Начальник управления | 1 |
| 2. | Заместитель начальника управления | 1 |
| 3. | Заместитель начальника управления - начальник отдела регионального сотрудничества и развития инновационной инфраструктуры | 1 |
| 4. | Заместитель начальника управления - начальник отдела инновационных проектов и интеллектуальной собственности | 1 |
| Управление финансирования, учета и отчетности |
| 1. | Начальник управления | 1 |
| 2. | Заместитель начальника управления | 1 |
| 3. | Заместитель начальника управления - начальник отдела бухгалтерского учета и отчетности (главный бухгалтер) | 1 |
| 4. | Заместитель начальника отдела бухгалтерского учета и отчетности (заместитель главного бухгалтера) | 2 |
| Управление федерального имущества научной сферы |
| 1. | Начальник управления | 1 |
| 2. | Заместитель начальника управления | 3 |
| 3. | Начальник отдела управления государственной собственностью | 1 |
| 4. | Начальник отдела капитальных вложений и материально-технического обеспечения | 1 |
| 5. | Заместитель начальника отдела капитальных вложений и материально-технического обеспечения | 1 |
| Управление делами |
| 1. | Начальник управления | 1 |
| 2. | Заместитель начальника управления | 1 |
| 3. | Заместитель начальника управления - начальник отдела государственной службы и кадров | 1 |