Закон вводит штраф за деятельность нежелательных организаций, если они не совершают действий, нарушающих уголовный кодекс. Для граждан России штраф составляет от пяти тыс. до 15 тыс. руб., для должностных лиц — от 20 тыс. до 50 тыс. руб., для юридических — от 50 тыс. до 100 тыс. руб.
Закон также запрещает кредитным и некредитным финансовым организациям проводить операции с денежными средствами и другим имуществом организаций, признанных нежелательными.
Нежелательной организацией может быть признана та, чья деятельность представляет угрозы основам конституционного строя России, ее обороне или безопасности.